哈哈，这个问题有意思了。《火影忍者》中初代火影细胞如此强大为何拥有的人还会死？实际上就是设定上的原因，为了剧情发展需要和力量平衡的考虑。下面具体说明一下。
柱间细胞的优势在于为拥有者提供强大的身体恢复能力和木遁攻击能力，并不是说拥有柱间细胞就可以避免死亡。
按照火影中的设定来说，火影主世界中真正能够做到不死的角色只有大筒木辉夜一个而已，主要是火影忍者中的攻击方式不能对大筒木辉夜的躯体造成有效杀伤。而千手柱间能够拥有柱间细胞得益于具备大筒木一族的血统，随着时间推移千手一族身上具备的大筒木血统越来越弱，弱化的表现就是即使拥有柱间细胞也不可能永生。
柱间细胞的恢复能力是有限度的，个人推测应该与千手柱间的身体机能和查克拉有关系，而千手柱间随着年龄增长和战争因素自身的身体机能是在逐渐衰竭的，最后导致的结果就是柱间细胞的恢复效果越来越差。加上柱间细胞的另一个作用就是能够使用木遁这种特殊的血继界限，并不是以维持生命为主的技能。自然不可能让柱间细胞拥有者保持不死了，加上后续移植柱间细胞的角色没有千手一族的血统，能否完全发挥柱间细胞的能力还是未知数。
柱间细胞的作用是在攻击方面和有限度的修复身体损伤方面，并不是说拥有柱间细胞就可以不死。依旧摆脱不了身体机能的丧失。
柱间细胞的作用有限制主要是剧情发展需要，毕竟这部作品是描写鸣人为主的，如果柱间细胞拥有者能够不死后面就没有鸣人的表现机会了。
大家都知道柱间细胞来源于六道仙人的仙人之体，能力十分强大。因此实际上为了剧情发展需要岸本还是限制了柱间细胞的能力，设想一下如果柱间细胞的拥有者真滴能够永生不死，后续忍者世界的格局就会发生相当大的变化。
六道仙人也在的话可能忍宗的发展会与剧情中的内容有很大不同，可能后续也不会存在各大忍者村的设定了，所有的人都会归属忍宗的统治。即使后面有千手柱间其他忍者家族也是不可能与千手一族对抗的，这样一来鸣人作为忍界救世主的作用就无法顺利发挥了。后续和佐助的羁绊以及推进忍者世界变革和人与人之间相互理解的内容也就无法实现了。
最后总结一下，个人认为火影中拥有柱间细胞的角色依旧会死亡的设定主要是维持火影中不同力量体系的实力平衡，否则无论是正派人物还是反派角色拥有柱间细胞，其他人就不用完了，分析不到位地方请见谅 各位有其他想法欢迎留言讨论。
